Doxygen是一種開源跨平臺的，以類似JavaDoc風格描述的文檔系統，完全支持C、C++、Java、Objective-C和IDL語言，部分支持PHP、C#。注釋的語法與Qt-Doc、KDoc和JavaDoc兼容。Doxgen可以從一套歸檔源文件開始，生成HTML格式的在線類瀏覽器，或離線的LATEX、RTF參考手冊。

Doxygen能將程序中的特定批注轉換成為說明文件。它可以依據程序本身的結構，將程序中按規范注釋的批注經過處理生成一個純粹的參考手冊，通過提取代碼結構或借助自動生成的包含依賴圖（include dependency graphs）、繼承圖（inheritancediagram）以及協作圖（collaboration diagram）來可視化文檔之間的關系，Doxygen生成的幫助文檔的格式可以是CHM、RTF、PostScript、PDF、HTML等。